Запустіть оновлення ще раз.
В нас таке було на версії 29.4 одноразово. Оператору якось випадково вдалося вилучити єдиний рядок. Скільки після того не створювали нові реєстри, повторити вилучення більше не вдалося. Може були зачеплені які то неопубліковані горячі комбінації клавіш. А у автора поста така сама проблема виникла на версії 29.5. Тому скоріш за все переустановка оновлення нічого не дасть. Або, якщо строчок багато, збирати ікс-ем-ел файл з двох файлів, якщо ж мало - перенабрати.
В принципі рядок повинен бути обо'язково, інакше це було б безглуздям.
Безглуздям є те, що пустий рядок включається в ікс-ем-ел файл і перед імпортуванням звіту в податковій інспектор з файлу вилучає відповідний пустий розділ, бо інакше імпорт не відбувається.
Але саме цікаве що та ж сама податкова програма по прийому звітів обробляє реєстр з пустим розділом, якщо він присланий по ємейлу.
одягти штани через голову
маючи вашу голову, я б теж опасався таке робити.