Уточнил у специалистов.
Заявление подается по основному месту учета.
По области есть несколько принятых заявлений.
По одному ФОПу заявление, в котором заводской номер указан правильно, согласно реестру РРО, (ПБ4101......) не принято.
А точно такое же, но с неправильным номером (4101......, без ПБ) принято.
При этом, такое же заявление, но на табак - не принято с ошибкой "не найдены реквизиты РРО".
По другому ФОПу есть принятые заявления, в которых указано код ДПС, куда подается заявление - код областной ДПС 1631 и код, где на учете не стоит, но файл подан по основному месту.